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高通量测序遗传病检测项目 推介会

发布:管理员  时间:2025-04-01

我院拟开展高通量测序遗传病检测项目推介会,欢迎符合条件的供应商积极报名参与。


一、服务内容:

提高临床分子诊断水平

二、检测资质与经验要求:

(一)产前染色体CNV检测

1.检测内容:23对染色体非整倍体、100K以上的缺失重复、宫内目标病原感染检测;

2.检测方法:低深度全基因组高通量测序(CNV-seq);

3.样本类型:流产组织、绒毛、羊水、脐带血、外周血等;

4.报告周期: 自采样起9天;

5.数据参数要求:平均有效数据量≥35M;单样本检测有效数据量要求≥20M reads;

6.资质要求:通过染色体基因组结构异常室间质量评价。检测设备获得NMPA认证。检测试剂盒及分析软件有注册证。

7.具有完善的质控流程及方案,检测过程从样本信息、样本检测前处理、检测、分析解读、报告、检测后等环节都有严格的质量控制点

8.具有CNV-seq智能化解读云平台,能提供智能化ACMG打分、变异注释、自动出报告等CNV解读本地化方案。

 

(二)产前染色体CNV检测plus

1.检测内容:三倍体、23对染色体非整倍体、100K以上的缺失重复、目标区域单亲二体、宫内目标病原感染检测、母源污染检测;

2.检测方法:低深度全基因组高通量测序(CNV-seq),短串联重复序列检测(STR),甲基化特异性qPCRMS-qPCR);

3.样本类型:流产组织、绒毛、羊水、脐带血、外周血等;

4.报告周期: 自采样起12天;

5.数据参数要求:平均有效数据量≥35M;单样本检测有效数据量要求≥20M reads;

6.资质要求:通过染色体基因组结构异常室间质量评价。检测设备获得NMPA认证。检测试剂盒及分析软件有注册证。

7.具有完善的质控流程及方案,检测过程从样本信息、样本检测前处理、检测、分析解读、报告、检测后等环节都有严格的质量控制点

8.具有CNV-seq智能化解读云平台,能提供智能化ACMG打分、变异注释、自动出报告等CNV解读本地化方案。

 

(三)新生儿遗传病基因筛查

1.检测内容:新生儿相关遗传病,不少于240基因不少于240种遗传病。

2.检测方法:目标区域捕获和高通量测序技术。

3. 报告周期:12个工作日。

4. 样本类型:外周血、干血片

5. 数据解读:

1)数据解读规则参考美国医学遗传学和基因组学学院(American College of Medical Genetics and GenomicsACMG)及ClinGen相关指南。

2)报告致病和疑似致病变异,报告范围需要包括DMD基因连续 2个外显子及以上的缺失 /重复, SMN1基因 7号外显子缺失,地中海贫血 HBA/HBB基因 --SEA -α3.7 -α4.2Chinese SEA-HPFH FIL THAI大片段缺失)。

6. 数据参数要求:

1)测序数据量不小于0.6 G

2Fastq数据Q20 90%Q30 85%

3)基因组比对率 > 99%

5)目标区域覆盖度 99%20X覆盖度 95%

6)核基因组去重平均测序深度≥100X、线粒体去重平均测序深度≥300X

7)捕获效率 >45%

8)对NGS分析流程中低质量的SNVCNV结果通过Sanger测序、qPCR等方法进行二次验证。

7. 资质要求:通过遗传病高通量测序检测生物信息学分析室间质量评价。检测设备获得NMPA认证。

 

(四)地中海贫血基因检测(508种)

检测内容:通过高通量测序方法,检测超过500种α和β地贫类型(涵盖α地贫缺失型、α地贫突变型、β地贫突变型和β地贫缺失型),同时能够检出α和β珠蛋白异常血红蛋白突变类型。

检测周期:15个工作日以内。

产品性能:投标人针对地贫的检测必须同时涵盖α地贫缺失型、α地贫突变型、β地贫突变型和β地贫缺失型及异常血红蛋白突变(提供详细检测列表);投标人针对地贫的检测范围应将HBA1HBA2HBB三个基因测通(含调控区、外显子和内含子);检测范围内的地贫类型准确率>99%

可检测样本类型:外周血、血斑、唾液和DNA

临床经验:地贫相关基因检测有充足临床经验。(提供已完成检测例数材料、与医院的合作记录等)

样本运输:24小时之内收样本,公司自有物流体系。

检测配套资质: 近三年参与全国地中海贫血基因分型室间质评,并合格通过;取得国家卫健委高通量基因测序技术遗传病诊断专业临床应用试点;

 

(五)单基因遗传病携带者筛查

检测内容:通过高通量捕获测序技术对常见的隐性单基因遗传病进行筛查

1)单基因遗传病携带者筛查(155种):

需覆盖包含SMADMD、α及β地贫等常见遗传病在内的155种疾病,致病或疑似致病变异≥9000个,报告需提示剩余风险。

2)单基因遗传病携带者筛查(41种):需覆盖包含SMADMD、α及β地贫等常见遗传病在内的41种疾病

3)单基因遗传病携带者筛查(10种):需覆盖包含SMADMD在内的10种常见隐性遗传病

检测周期:15个工作日以内。

产品性能:与sanger测序法符合率>99.9%以上,特异性>99%

可检测样本类型:外周血或DNA

临床经验:单基因遗传病携带者筛查相关检测有充足临床经验。(提供已完成检测例数材料、与医院的合作记录等)

样本运输:24小时之内收样本,公司自有物流体系。

检测配套资质:具备医疗机构执业许可证、卫生部临检中心PCR实验室、高通量基因测序医学实验室通过ISO 15189医学实验室管理体系与CAP/ CLIA医学实验室认证、取得卫健委高通量基因测序技术遗传病诊断专业临床应用试点;

 

(六)癫痫用药指导基因检测

检测药物(不少于12种):奥卡西平、苯巴比妥、苯妥英、丙戊酸、布瓦西坦、卡马西平、拉考沙胺等。

检测基因(不少于10个):HLA-BHLA-ASCN2ACYP2C9POLGCYP2C19等。

检测位点(不少于28个):HLA-B*15:02/*51:01rs1128503rs2032582rs4244285rs4986893rs28399504rs12248560rs1799853rs1057910rs1800497rs113994095rs113994097rs762551等。

检测周期:10个工作日。

样本类型:多种样本类型可选,如全血、干血片、口腔拭子。

报告形式:报告中明确展示药物与基因及位点对应关系。需包含位点检测结果、药物用药建议及用药建议详细解读。每种药物的解读依据需在报告中列明。

准确率:位点分型与sanger测序法符合率99.9%以上。

服务:为保证项目检测后的服务质量,投标方需具备遗传咨询服务团队,能同时提供线上遗传咨询服务,需附上遗传咨询团队咨询经验介绍及在线咨询服务流程。并有专门客服团队承接检测咨询服务。

投标人个体化用药指导基因检测项目有充足临床经验(提供已完成检测例数材料)。

投标人资质:具有《医疗机构执业许可证》;通过当地省临床检验中心临床基因扩增检验实验室验收合格(提供验收合格证书复印件,原件备查);应通过医学检验实验室质量管理体系认证 ,获ISO 9001ISO 14001ISO 15189ISO 17025质量管理体系审核认证;具有生物样本库和数据库,可为招标单位提供生物样本、基因数据的存储服务,为后续科研作支持。

 

(七)儿童个体化用药指导基因检测

检测药物(不少于130种):阿芬太尼、阿司匹林、氨基比林、布洛芬、丁丙诺啡、芬太尼、吗啡、哌替啶、喷他佐辛、羟考酮、曲马多、舒芬太尼、双氯芬、丙酸氟替卡松、布地奈德、沙丁胺醇、沙美特罗/氟替卡松、右美沙芬、阿米卡星、氨基水杨酸、吡嗪酰胺、达卡他韦、呋喃妥因、呋喃西林、呋喃唑酮、伏立康唑、复方磺胺甲噁唑等。

检测基因(不少于70个):CYP2C19CYP2D6CYP3A4G6PDOPRM1MT-RNR1PTGS1CHIAGP1BALTC4SADRB1ABCB1等。

检测位点(不少于120个):rs1799971rs267606617rs267606618rs267606619rs10306114rs3818822rs6065rs730012rs4244285rs4986893rs28399504rs12248560rs12346562rs1801252等。

检测周期:10个工作日.

样本类型:多种样本类型可选,如全血、干血片、口腔拭子。

报告形式:报告中明确展示药物与基因及位点对应关系。需包含位点检测结果、药物用药建议及用药建议详细解读。每种药物的解读依据需在报告中列明。

准确率:位点分型与sanger测序法符合率99.9%以上。

服务:为保证项目检测后的服务质量,投标方需具备遗传咨询服务团队,能同时提供线上遗传咨询服务,需附上遗传咨询团队咨询经验介绍及在线咨询服务流程。并有专门客服团队承接检测咨询服务。

投标人个体化用药指导基因检测项目有充足临床经验(提供已完成检测例数材料)。

投标人资质:具有《医疗机构执业许可证》;通过当地省临床检验中心临床基因扩增检验实验室验收合格(提供验收合格证书复印件,原件备查);应通过医学检验实验室质量管理体系认证 ,获ISO 9001ISO 14001ISO 15189ISO 17025质量管理体系审核认证;具有生物样本库和数据库,可为招标单位提供生物样本、基因数据的存储服务,为后续科研作支持。

 

(八)遗传性耳聋基因检测(4基因20位点)

检测内容:通过高通量测序方法,检测4个常见耳聋基因(GJB2SLC26A4MT-RNR1GJB3),覆盖GJB2GJB3SLC26A4MT-RNR14个耳聋基因的常见位点数≥20个位点。

检测周期:10个工作日以内。

产品性能:准确率高,与sanger测序法符合率100%,特异性在99.9%以上,可检出杂合、纯合、复合杂合突变等位点。

可检测样本类型:全血、干血斑、DNA

临床经验:耳聋相关基因检测有充足临床经验。(提供已完成检测例数材料、与医院的合作记录等)

样本运输:24小时之内收样本,公司自有物流体系。

检测配套资质:检测设备、分析软件获得NMPA认证;具有生物样本库和数据库,可为招标单位提供生物样本、基因数据的存储服务,为后续科研作支撑

 

(九)遗传性耳聋基因检测(24基因208位点)

检测内容:通过高通量测序方法,检测耳聋基因≥20个,包含常见的GJB2GJB3SLC26A4MT-RNR1OTOFTMC1等;检测位点≥200位点。覆盖先天性聋、大前庭水管综合征、药物性聋、听神经病、尤赛氏综合征等耳聋疾病。

检测周期:10个工作日以内。

产品性能:与sanger测序法符合率>99.9%,可检出杂合、纯合、复合杂合突变等位点。

可检测样本类型:全血、干血斑、DNA

临床经验:耳聋相关基因检测有充足临床经验。(提供已完成检测例数材料、与医院的合作记录等)

样本运输:24小时之内收样本,公司自有物流体系。

检测配套资质:检测设备、分析软件获得NMPA认证;具有生物样本库和数据库,可为招标单位提供生物样本、基因数据的存储服务,为后续科研作支撑

 

(十)遗传性耳聋基因检测(NGS Panel 127基因)

1.  基本需求

检测内容:综合征与非综合征型型耳聋相关基因检测,基因数不少于120个,包含线粒体上耳聋相关基因。可检出点突变、小片段缺失/插入突变等突变类型。检测结果需要使用“金标准”Sanger测序进行验证,包含父母验证结果 样本类型:外周血

检测技术:目标序列捕获+高通量测序技术。

检测周期: 20个工作日。

样本运输:24小时之内收样本,公司自有物流体系

2.设备要求:设备获得NMPA认证

 

(十一)胎儿显性单基因病无创产前筛查

1.检测内容:针对孕妇外周血中的胎儿游离DNA,检测不少于150个显性单基因遗传病相关基因,关联疾病不少于200种;

2.检测方法:分子标签建库、目标区域捕获-高通量测序技术,检测目标基因的编码区及其上下游30bp范围;

3.报告周期:15个工作日;

4.样本类型:孕妇外周血;

5.数据参数要求:单个样本测序数据量>18G,有效数据量>100M reads,检测范围内>99%的区域测序深度>500X,平均测序深度≥800X

6.资质要求:检测设备获得NMPA认证;

 

(十二)NIPT plus胎儿染色体异常产前基因检测

1.检测内容:21-三体综合征、18-三体综合征和13-三体综合征、性染色体异常在内的所有染色体非整倍体异常,不少于88种临床明确的染色体缺失重复综合征。

2.检测质量要求:每个样品不少于25M reads。无创产前胎儿染色体非整倍体检测,21 三体综合征检出率应不低于99%18 三体综合征检出率应不低于97%13 三体综合征检出率应不低于90%;复合假阳性率应不高于0.5%

3.报告周期:10个工作日

4.样本类型:孕妇外周血

5.资质要求:基因测序仪、分析软件、检测试剂盒具备NMPA批准可用于临床检测。近四年参与全国外周血胎儿染色体非整倍体(T21T18T13)高通量基因检测室间质评,并合格通过

6.其他要求:需为受检人群购买保险,阳性报销:211813三体,其他染色体异常,双胎保额增加;假阴报销:包含除211813三体之外的其他染色体数目异常和缺失重复综合征、出生后检测结果假阴性赔付不低于40万、出生前检测结果假阴性不低于2万。

 

(十三)全基因组测序WGS

1.检测内容:一次性检测人类基因组中2万多个基因,可分析的变异包括: 核基因编码及非编码区(包括外显子、内含子区,启动子区和基因间区域等)的点突变(SNV)、小片段插入缺失(InDel),外显子水平的拷贝数变异 (ExonCNV) 基因组大片段拷贝数变异(Large CNV)及线粒体变异等,并可提示染色体纯合区域 (ROH)、易位倒位等结构变异(SV)、部分动态突变等。

2.检测方法:高通量测序技术。

3.可检测标本类型:外周血,基因组DNA,羊水等。

4.报告周期:30天。

5.检测资质与经验要求:通过遗传病高通量测序检测生物信息学分析室间质量评价(提供近三年证书)。检测设备获得NMPA认证。既往已完成的高通量测序项目不少于20万例。

6.测序质量要求:去重测序深度>40X20X覆盖度≥90%,线粒体200X覆盖度≥99%且线粒体拷贝数≥50

7.数据分析能力要求:具有自主研发生物信息分析平台,数据解读规则参考美国医学遗传学和基因组学学院(ACMG)相关指南,报告中致病位点给出明确的致病性评级证据项。数据库(clinvar, OMIM, gnomADHGMDdbSNP等)更新及时。

8.其他服务要求

1)所有测序和数据分析过程,招标方可以实时知情,全程参与。

2)所有测序原始数据定期提供给招标方。

3)免费向招标方提供项目相关的技术培训服务,定期开展遗传咨询讨论会议,帮助招标方遗传咨询相关人才培养工作。

4)向招标方提供测序数据深度挖掘的科研服务。

5)为招标方配置本地化遗传数据分析/存储设施及数据库。

 

三、提交纸质文件的组成及要求

1、提供上述第二条要求的相关文件复印件。

2、在文件首页注明报名单位名称、联系人及联系电话;

3、每页资料必须加盖公章。

四、提交电子版资料

1、将Word版明细表(公司名称、资质证照等)发QQ电子邮箱2631663756@qq.com

2、温馨提醒:纸质文件和电子版资料都在规定时间内提交才算报名成功。

五、其他

1、报名时间:202541-47日(工作日)

2、报名地点:武汉儿童医院医务部 老妇幼楼五楼

3、会议时间:具体时间另行通知。

4、联系人: 蔡老师  联系电话:027-82433161

 

 


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